MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae F3047 chromosome

Total Repeats: 42375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014922	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	319774952
2	NC_014922	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774952
3	NC_014922	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
4	NC_014922	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
5	NC_014922	A	6	6	344	349	100 %	0 %	0 %	0 %	319774952
6	NC_014922	GTTC	2	8	388	395	0 %	50 %	25 %	25 %	319774952
7	NC_014922	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774952
8	NC_014922	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774952
9	NC_014922	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
10	NC_014922	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	319774952
11	NC_014922	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774952
12	NC_014922	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774952
13	NC_014922	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
14	NC_014922	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774952
15	NC_014922	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
16	NC_014922	TGT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
17	NC_014922	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	319774952
18	NC_014922	TAG	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
19	NC_014922	CTACAA	2	12	1003	1014	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319774952
20	NC_014922	A	6	6	1033	1038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014922	T	6	6	1059	1064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014922	AATTT	2	10	1074	1083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014922	AAT	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014922	CAAT	2	8	1127	1134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014922	TTC	2	6	1136	1141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014922	CAA	3	9	1248	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
27	NC_014922	TCAA	2	8	1345	1352	50 %	25 %	0 %	25 %	319774953
28	NC_014922	TTGC	2	8	1365	1372	0 %	50 %	25 %	25 %	319774953
29	NC_014922	ATA	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774953
30	NC_014922	AGCA	2	8	1501	1508	50 %	0 %	25 %	25 %	319774953
31	NC_014922	TCG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774953
32	NC_014922	TCA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
33	NC_014922	A	6	6	1609	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	319774953
34	NC_014922	CAATT	2	10	1633	1642	40 %	40 %	0 %	20 %	319774953
35	NC_014922	ACA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
36	NC_014922	TTA	2	6	1678	1683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
37	NC_014922	CAA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
38	NC_014922	ATTT	2	8	1747	1754	25 %	75 %	0 %	0 %	319774953
39	NC_014922	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
40	NC_014922	CTTT	2	8	1878	1885	0 %	75 %	0 %	25 %	319774953
41	NC_014922	T	6	6	1883	1888	0 %	100 %	0 %	0 %	319774953
42	NC_014922	TC	3	6	1894	1899	0 %	50 %	0 %	50 %	319774953
43	NC_014922	GGC	2	6	1919	1924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774953
44	NC_014922	TTC	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774953
45	NC_014922	AGA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
46	NC_014922	A	6	6	2038	2043	100 %	0 %	0 %	0 %	319774953
47	NC_014922	GAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
48	NC_014922	ATT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
49	NC_014922	G	6	6	2231	2236	0 %	0 %	100 %	0 %	319774953
50	NC_014922	ATG	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774953
51	NC_014922	GGA	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774953
52	NC_014922	AAC	2	6	2342	2347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
53	NC_014922	AAT	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774953
54	NC_014922	GTG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774953
55	NC_014922	TGA	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774953
56	NC_014922	AGA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
57	NC_014922	AGA	2	6	2516	2521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
58	NC_014922	ATTT	2	8	2569	2576	25 %	75 %	0 %	0 %	319774953
59	NC_014922	AT	3	6	2621	2626	50 %	50 %	0 %	0 %	319774953
60	NC_014922	CAC	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774953
61	NC_014922	AT	3	6	2636	2641	50 %	50 %	0 %	0 %	319774953
62	NC_014922	ATC	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
63	NC_014922	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	319774953
64	NC_014922	GAA	2	6	2745	2750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
65	NC_014922	ACT	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
66	NC_014922	A	6	6	2798	2803	100 %	0 %	0 %	0 %	319774953
67	NC_014922	AGC	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774953
68	NC_014922	A	7	7	2876	2882	100 %	0 %	0 %	0 %	319774953
69	NC_014922	GCAA	2	8	2974	2981	50 %	0 %	25 %	25 %	319774953
70	NC_014922	AAG	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
71	NC_014922	CTTT	2	8	3038	3045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014922	ATT	2	6	3050	3055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
73	NC_014922	TCT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774954
74	NC_014922	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
75	NC_014922	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
76	NC_014922	A	6	6	3253	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	319774954
77	NC_014922	CGCAC	2	10	3259	3268	20 %	0 %	20 %	60 %	319774954
78	NC_014922	A	6	6	3301	3306	100 %	0 %	0 %	0 %	319774954
79	NC_014922	T	6	6	3342	3347	0 %	100 %	0 %	0 %	319774954
80	NC_014922	TCT	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774954
81	NC_014922	AAT	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
82	NC_014922	TCA	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774954
83	NC_014922	ATTT	2	8	3479	3486	25 %	75 %	0 %	0 %	319774954
84	NC_014922	ATT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
85	NC_014922	TAA	2	6	3520	3525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
86	NC_014922	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774954
87	NC_014922	ATT	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
88	NC_014922	GAG	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774954
89	NC_014922	TAA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
90	NC_014922	CAT	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774954
91	NC_014922	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774955
92	NC_014922	ATC	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774955
93	NC_014922	TTC	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774955
94	NC_014922	AAC	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774955
95	NC_014922	TC	4	8	4033	4040	0 %	50 %	0 %	50 %	319774955
96	NC_014922	GAC	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774955
97	NC_014922	ATTCT	2	10	4318	4327	20 %	60 %	0 %	20 %	319774955
98	NC_014922	TGG	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014922	TGTA	2	8	4408	4415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014922	AAT	2	6	4437	4442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014922	CCA	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_014922	TC	3	6	4561	4566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014922	TTGG	2	8	4571	4578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014922	TTTCCT	2	12	4615	4626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774956
105	NC_014922	T	6	6	4733	4738	0 %	100 %	0 %	0 %	319774956
106	NC_014922	CTCG	2	8	4753	4760	0 %	25 %	25 %	50 %	319774956
107	NC_014922	TAAAA	2	10	4770	4779	80 %	20 %	0 %	0 %	319774956
108	NC_014922	CCAA	2	8	4806	4813	50 %	0 %	0 %	50 %	319774956
109	NC_014922	T	7	7	4930	4936	0 %	100 %	0 %	0 %	319774956
110	NC_014922	AAG	2	6	5013	5018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774956
111	NC_014922	TTC	2	6	5023	5028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774956
112	NC_014922	AGG	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774956
113	NC_014922	ATT	2	6	5118	5123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774956
114	NC_014922	CG	3	6	5125	5130	0 %	0 %	50 %	50 %	319774956
115	NC_014922	TGT	2	6	5177	5182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774956
116	NC_014922	TA	3	6	5183	5188	50 %	50 %	0 %	0 %	319774956
117	NC_014922	AGC	2	6	5215	5220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774956
118	NC_014922	ATC	2	6	5273	5278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014922	CAGT	2	8	5279	5286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014922	GTG	2	6	5288	5293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014922	TTG	2	6	5459	5464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014922	TTA	2	6	5548	5553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014922	CAT	2	6	5642	5647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014922	ATC	2	6	5701	5706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014922	GAA	2	6	5766	5771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014922	ATC	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014922	GTTCTG	2	12	5849	5860	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014922	AAAC	2	8	5900	5907	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014922	TGA	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014922	GAA	2	6	6004	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014922	TGA	2	6	6048	6053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014922	ACA	2	6	6084	6089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014922	TAAAA	2	10	6167	6176	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014922	CTT	2	6	6180	6185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014922	GAA	2	6	6196	6201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014922	GAT	2	6	6300	6305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014922	TAT	2	6	6511	6516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014922	ATG	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014922	TGA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014922	AAATAA	2	12	6714	6725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014922	ATC	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014922	ATG	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014922	ACT	2	6	6868	6873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014922	AGA	3	9	6882	6890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014922	TTCT	2	8	6977	6984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014922	GAA	2	6	6994	6999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014922	A	6	6	7015	7020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014922	TGA	2	6	7203	7208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014922	ACA	3	9	7213	7221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014922	CCG	2	6	7344	7349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_014922	CAT	2	6	7367	7372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014922	AACTGG	2	12	7432	7443	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_014922	GTA	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014922	AGA	2	6	7650	7655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014922	CAA	2	6	7697	7702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_014922	ATC	2	6	7756	7761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_014922	CACAAC	2	12	7763	7774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_014922	TCG	2	6	7848	7853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014922	CGGT	2	8	7868	7875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_014922	A	6	6	7986	7991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014922	TTA	2	6	8027	8032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014922	AT	4	8	8154	8161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014922	TTG	2	6	8194	8199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014922	TTG	2	6	8216	8221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014922	A	6	6	8226	8231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014922	CAC	2	6	8232	8237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_014922	GAA	2	6	8253	8258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014922	GAAAAA	2	12	8360	8371	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014922	TAT	2	6	8398	8403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014922	GA	3	6	8410	8415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014922	ATT	2	6	8566	8571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774957
172	NC_014922	TAT	2	6	8572	8577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774957
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189	NC_014922	ATT	2	6	9355	9360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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227	NC_014922	AAT	2	6	11333	11338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
228	NC_014922	TAT	2	6	11348	11353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_014922	AT	3	6	11385	11390	50 %	50 %	0 %	0 %	319774961
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233	NC_014922	T	7	7	11545	11551	0 %	100 %	0 %	0 %	319774961
234	NC_014922	ATTT	2	8	11582	11589	25 %	75 %	0 %	0 %	319774961
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259	NC_014922	TTATT	2	10	12965	12974	20 %	80 %	0 %	0 %	319774963
260	NC_014922	CATT	2	8	13011	13018	25 %	50 %	0 %	25 %	319774963
261	NC_014922	CTT	2	6	13021	13026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774963
262	NC_014922	T	7	7	13068	13074	0 %	100 %	0 %	0 %	319774963
263	NC_014922	GAT	2	6	13117	13122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774963
264	NC_014922	ACG	2	6	13208	13213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774963
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266	NC_014922	TTG	2	6	13288	13293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774963
267	NC_014922	T	6	6	13375	13380	0 %	100 %	0 %	0 %	319774963
268	NC_014922	AAT	2	6	13418	13423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774963
269	NC_014922	GCT	2	6	13488	13493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774963
270	NC_014922	TTG	2	6	13526	13531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774963
271	NC_014922	AAT	2	6	13580	13585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774963
272	NC_014922	A	6	6	13638	13643	100 %	0 %	0 %	0 %	319774963
273	NC_014922	CAAA	2	8	13696	13703	75 %	0 %	0 %	25 %	319774963
274	NC_014922	A	6	6	13701	13706	100 %	0 %	0 %	0 %	319774963
275	NC_014922	GAAC	2	8	13707	13714	50 %	0 %	25 %	25 %	319774963
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283	NC_014922	A	6	6	13997	14002	100 %	0 %	0 %	0 %	319774963
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401	NC_014922	A	7	7	20058	20064	100 %	0 %	0 %	0 %	319774968
402	NC_014922	TGT	2	6	20085	20090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774968
403	NC_014922	CT	3	6	20102	20107	0 %	50 %	0 %	50 %	319774968
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